Cygwin to narzędzie pozwalające na zmianę wyglądu systemu Windows na ten znany z Linux. Stanowi ono swoistą nakładkę, która emuluje nie tylko wygląd, ale również pozwala na uruchamianie linuksowych aplikacji w środowisku spod znaku Microsoftu.
Cygwin zbudowano w oparciu o zestaw bibliotek DLL,, które dostarczają systemowi funkcjonalności POSIX API. Komponenty takie jak syslogd, inetd, crond oraz inne sprawiają, iż Windows zachowuje się jak Linux. Podczas instalacji systemu należy dobrać adekwatną liczbę pakietów, w przeciwnym razem cały proces może się wydłużyć.
Domyślnie zaznaczonych jest kilka podstawowych programów konsolowych oraz sama powłoka bash. Inne narzędzia takie jak edytory tekstu, powłoki (dash, zsh, tcsh), serwery (Apache, PostgreSQL, OpenSSH) są dostępne w dodatkowych paczkach. Należy pamiętać, iż aplikacje emulowane w Cygwin mogą działać znacznie wolniej niż po uruchomieniu w Linux.
Cygwin może być pomocny podczas portowania aplikacji z Linux na Windows, bowiem dostarcza na system Microsoftu kompilatory gcc oraz debugger gdb.